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日高山脈によって北海道東部および北海道西部・東北地方北部の2地域に分かれていた。

北海道・渡島半島南部と青森県・下北半島北部のニホンザリガニは互いに遺伝的な分化が小さいことから、津軽海峡がかつては陸続き(陸橋)だった可能性を示す、新たな生物学的証拠だという。